1979年9月，柳州市柳南区成立。

1990年，柳南区分柳南、柳石、南站、鹅山、河西5个街道，设立5个街道办事处，分辖37个居民委员会、24条路（街）和28条巷（里）。区域面积27.12平方公里，人口约22.82万人。

2002年9月，柳州市原郊区西鹅乡、太阳村镇的全部和黄村乡的磨滩、渡口、基隆3个行政村，羊角山镇的门头、帽合、新云3个行政村划归柳南区。

2005年7月，柳州市部署乡镇撤并，改设街道，撤销西鹅乡建制，柳南区增设南环、潭西2个街道，同时设立南环、潭西2个街道办事处，原西鹅乡的10个行政村分别划归太阳村镇和南环街道。同时，柳南区调整太阳村镇和部分街道行政区划，把部分社区、村屯划归南环、潭西2个街道。年末，柳南区共划分为柳南、柳石、南站、鹅山、河西、银山、南环、潭西8个街道和太阳村镇1个镇，分辖50个社区、21个村（镇居委会）。

2019年5月，调整柳江区、柳南区行政区划，将柳江区的洛满镇、流山镇划入柳南区管辖。调整后，柳南区辖太阳村、洛满、流山3个镇和河西、柳南、柳石、南站、鹅山、银山、潭西、南环8个街道。分辖55个城市社区、39个行政村、1个镇居委会、2个镇社区。行政区域面积541.37平方公里。